22JR1200, 유전자-주석-질병간 연관성 분석을 위한 문헌 데이터 마이닝 기술 개발,
박수준
초록
In this paper, a tagging tool is developed to streamline the process of locating tags for each term and manually selecting the target term. It directly extracts the terms to be tagged from sentences and displays it to the user. It also increases tagging efficiency by allowing users to reflect candidate categories in untagged terms. It is based on annotations automatically generated using machine learning. Subsequently, this architecture is fine-tuned using Bidirectional Encoder Representations from Transformers (BERT) to enable the tagging of terms that cannot be captured using Named-Entity Recognition (NER). The tagged text data extracted using the proposed tagging tool can be used as an additional training dataset. The tagging tool, which receives and saves new NE annotation input online, is added to the NER and RE web interfaces using BERT. Annotation information downloaded by the user includes the category (e.g., diseases, genes/proteins) and the list of words associated to the named entity selected by the user. The results reveal that the RE and NER results are improved using the proposed web service by collecting more NE annotation data and fine-tuning the model using generated datasets. Our application programming interfaces and demonstrations are available to the public at via the website link provided in this paper.
KSP 제안 키워드
Annotation data, Application programming interface, Named Entity Recognition, Web service(WS), annotation information, biomedical text, fine-tuning, machine Learning, tagging tool, text data, web interface
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<출처표시방법 안내> 작성자, 저작물명, 출처, 권호, 출판년도, 이용조건 [예시1] 김진미 외, "매니코어 기반 고성능 컴퓨팅을 지원하는 경량커널 동향", 전자통신동향분석, 32권 4호, 2017, 공공누리 제4유형 [예시2] 심진보 외, "제4차 산업 혁명과 ICT - 제4차 산업 혁명 선도를 위한 IDX 추진 전략", ETRI Insight, 2017, 공공누리 제 4유형
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