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Conference Paper
EP-tree 마이닝을 이용한 단백질 DISORDER/ORDER 지역 분류
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- Issue Date
- 2011-05
- Citation
- 한국정보처리학회 학술 발표 (춘계) 2011, pp.1274-1277
- Publisher
- 한국정보처리학회 (KIPS)
- Language
- Korean
- Type
- Conference Paper
- Abstract
- 단백질 1차 서열로부터 DISORDER와 ORDER지역을 예측하기 위해서 이 논문에서는 EP-tree에 기반한 출현패턴 발견 알고리즘을 제안하였다. EP-tree 알고리즘을 적용함으로서 기존의 단백질 특징 추출을 통한 방법과 달리 서열 자체에서 발견되는 출현패턴만을 이용하여 분류 모델을 생성하므로 기존의 신경망이나 SVM 보다 분류모델 생성 및 예측 속도가 빠르다. 또한 Disprot 4.9과 CASP7 테스트 데이터로 DISORDER/ORDER 지역을 예측한 결과, 73.4%의 높은 정확성을 보였다.