상세정보
등록 미지의 단백질 특성 예측 장치 및 그 방법
- 출원번호
- 10-2006-0121754 (2006.12.04)
- 등록번호
- 10-0799541-0000 (2008.01.24)
- 출원국
- 대한민국
- 협약과제
- 06MB1700, 바이오 데이터 마이닝 통합관리 핵심 S/W 컴포넌트 개발, 박선희
- 초록
- 1. 청구범위에 기재된 발명이 속한 기술분야본 발명은 단백질 상호작용 네트워크(이하, "PPI 네트워크"라 함)에서 특성이 알려지지 않은 단백질의 특성을 예측하기 위한, 미지의 단백질 특성 예측 장치 및 그 방법에 관한 것임.2. 발명이 해결하려고 하는 기술적 과제본 발명은 단백질 상호작용 네트워크에 존재하는 단백질 중에서 특성이 알려지지 않은 단백질의 특성을 유전자 온톨로지(GO : Gene Ontology) 용어들의 레벨 정규화와 단백질 상호작용 데이터를 이용한 특성관계행렬을 통하여 예측함으로써, 생물학적으로 의미 있는 후보 단백질을 추출할 수 있어 신약 개발이나 의료 진단과 같은 고비용의 생물학적 실험에 드는 비용을 줄일 수 있는 미지의 단백질 특성 예측 장치 및 그 방법을 제공하는데 그 목적이 있음.3. 발명의 해결방법의 요지본 발명은, 미지의 단백질 특성 예측 장치에 있어서, 외부의 PPI 네트워크에 존재하는 유전자 온톨로지(GO : Gene Ontology) 용어들의 유사도를 계산하여 유전자 온톨로지(GO) 용어 레벨을 정규화하기 위한 유전자 온톨로지(GO) 용어 레벨 정규화 수단; 상기 PPI 네트워크로부터의 데이터와 상기 유전자 온톨로지(GO) 용어 레벨 정규화 수단으로부터의 데이터를 이용하여 특성관계행렬(Feature Relationship Matrix)을 생성하기 위한 특성관계행렬 생성 수단; 상기 PPI 네트워크로부터의 데이터와 상기 유전자 온톨로지(GO) 용어 레벨 정규화 수단으로부터의 데이터를 이용하여 카이 스퀘어 값을 계산하기 위한 카이 스퀘어 값 계산 수단; 및 상기 카이 스퀘어 값 계산 수단에서 계산된 카이 스퀘어 값과 상기 특성관계행렬 생성 수단에서 생성된 특성관계행렬을 이용하여 미지의 단백질의 특성을 예측하기 위한 단백질 특성 예측 수단을 포함함.4. 발명의 중요한 용도본 발명은 PPI 네트워크에 존재하는 미지의 단백질의 특성 예측 등에 이용됨.단백질 상호작용 네트워크, 특성 예측, 유전자 온톨로지(GO : Gene Ontology), 용어 레벨 정규화, 특성관계행렬, 카이 스퀘어(Chi-square) 알고리즘
- KSP 제안 키워드
- Chi-square, Gene ontology